自20世纪80年代，肯·韦伯开创了“整合学”后，美国人率先开始反思自我、寻求突破，并提出了“替代医学”的新概念，将目光投向了草药等自然疗法、心理治疗、运动治疗、石英晶体治疗等传统疗法，希望能在现代医学体系中，重新整合传统医学的精髓，以此突破医学发展的“瓶颈”！
科学家们应用信息论、控制论、系统论思想对现代医学的预防医学、临床医学和康复医学以及传统医学中的相关理论进行了重新审视和整合，并由此提出了替代医学的核心理论“基因稳态—自我康复论”。
替代医学认为，维持机体健康的根本因素是机体整体及其微观各系统内部及系统间的稳定，这种稳定在宏观上通过机体的神经、内分泌、免疫三个系统的整体调节实现；而其微观上的物质基础则是为分子水平上的基因稳定表达。稳定是相对的、动态的，因为人每时每刻都会受到致病因子的侵袭，基因存在的内环境随时都会发生变化。基因具有自我调控和修复错误的能力，受到外来或内在的侵袭，基因稳态被打破时，就可以调动上述功能，通过一系列的反应，消弭致病因子及其影响，恢复基因的稳定，我们将之称为机体的自我康复力；而当致病因子的作用强大到超出机体的自我康复力时，机体就不能再靠自身的能力维持基因稳定，紊乱的基因表达就带来疾病。因此，治疗的根本就在于通过种种手段消弭致病因子的影响，提高机体的自我康复能力，最终重建基因稳态。
